Многопрофильный медицинский центр «Машук Аква-Терм» реализует 24 программы лечения (в том числе Detox и спец программы для детей от 4-х лет). Для лечения применяются минеральные, йодо-бромные, сухие углекислые, солодковые и скипидарные ванны. Помимо минеральной воды, в процессе лечения используются целебные грязи озера Тамбукан. Центр оснащен современным медицинским оборудованием и собственной лабораторией. Специализируется на лечении заболеваний органов дыхания, пищеварения, суставов и позвоночника, урологии, гинекологии. Прием ведут более 20 узких специалистов. Кроме медицинских программ, рассчитанных на пребывание гостей от 10 дней, в «Машук Аква-Терм» действуют 8 специализированных модульных экспресс-программ, позволяющих проводить диагностику, лечение и получать результат при коротком сроке пребывания от 3 дней. Это такие востребованные программы как «СтопПаника», «Экспресс-детокс» и «Чек-ап». Особой популярностью у гостей пользуются короткие велнес-программы, направленные на быстрое восстановление всего организма: физического и ментального. Реализация таких программ стала возможна благодаря совместной практике специалистов медицинского, когнитивного и велнес центров курорта.

В «Машук Аква-Терм» расположен единственный на юге России Центр развития мозга. В уютном и креативном пространстве занимаются пациенты всех возрастов. Применяемые в Центре методики помогают не только корректировать неврологические нарушения, но и качественно менять жизнь взрослых и детей: справляться с тревогой, выходить из депрессий и улучшать сон.

Отличительной особенностью санатория «Машук Аква-Терм» является его многопрофильность. Разработали узкоспециализированные программы, направленные на конкретные группы болезней:
- Восстановление после короновирусной инфекции
- Реабилитация детей, перенесших Covid-19 с 4 до 14 лет
- Лечение заболеваний органов дыхания у детей с 4 до 14 лет
- Детская (с 4 до 12 лет) реабилитационная гастроэнтерологическая программа
- Президентская программа (для женщин)
- Президентская программа (для мужчин)
- Программа "Detox Aqua Term"
- Лечение позвоночника
- Программа лечения суставов
- Улучшение сна, памяти и внимания
- Лечение заболеваний органов пищеварения
- Антистресс
- Профилактика гриппа и других вирусных заболеваний
- Профилактика гриппа и других вирусных заболеваний (для детей)
- Программа лечения и профилактики сердечно-сосудистых заболеваний
- Лечение сахарного диабета
- Урологическая программа
- Гинекологические заболевания

В инновационном санаторно-курортном комплексе «Машук Аква-Терм» реализуется универсальная комплексная экспресс-диагностическая программа CHECK-UP:
- CHEK UP 50 +
- CHECK-UP для женщин 30-40 лет
- CHECK-UP для женщин 40-50 лет
- CHECK-UP для мужчин 30-40 лет
- CHECK-UP для мужчин 40-50 лет
- Диагностическая программа CHECK - UP 2 дня (гинекология)
- Диагностическая программа CHECK - UP 2 дня (урология)
- Диагностическая программа CHECK-UP MINI «Здоровое сердце»
- Диагностическая программа ОНКО - CHECK - UP

Новые велнесс-программа на 7 дней:
- Модуль «Энерджи»
- Модуль «Релакс»
- Модуль «Баланс»
- Модуль «Активное долголетие»
- Модуль «Экспресс-детокс»